Клинической базой кафедры является Национальный научный центр наркологии МЗ РФ. В структуру ННЦН входят отделения психофармакологии, занимающееся изучением новых лекарственных средств для лечения наркологических заболеваний. Отделение проблем алкоголизма, занимающееся в последние годы изучением проблем женского алкоголизма. Отделение полинаркоманий, занимающееся изучением сочетанных форм наркоманий и аффективной патологией у наркологических больных. Отделение интенсивной терапии, изучает методы быстрой детоксикации и лечения осложненных форм наркологических заболеваний. Отделение психотерапии занимается разработкой методик психотерапии для лечения наркологических заболеваний.

Коечный фонд клиники – 160 коек. Площадь учебных помещений 180 кв.м. Количество учебных комнат- 3. Материально-техническое оснащение базовой клиники соответствует современному уровню научно-технического прогресса. Кафедра имеет возможность пользоваться оборудованием клиники, не являясь прямым его собственником. В Национальном научном центре наркологии существует диссертационный совет, осуществляющий организацию процедуры защиты кандидатских и докторских диссертаций.