Кафедра наркологии была организована в структуре факультета усовершенствования врачей ММА им. И.М.Сеченова в 1990 г. Её заведующим был избран профессор Николай Николаевич Иванец, являвшийся директором НИИ наркологии МЗ СССР. Этот Институт стал клинической базой кафедры. Необходимость создания кафедры обосновывалась высокой потребностью московской наркологической службы в повышении квалификации врачей-психиатров-наркологов. Сама служба была сформирована в 1975-76 гг., выделившись в качестве самостоятельной из сети психоневрологических учреждений. Врачебные кадры для неё привлекались из числа психиатров, а также отбирались среди специалистов других медицинских дисциплин. Параллельно с накоплением опыта практической работы отдельных врачей нарастал объём теоретических знаний по наркологии, что требовало систематического обобщения и распространения этих знаний и опыта на всю службу. Эту задачу должен был выполнить Всесоюзный научно-исследовательский институт медико-биологических проблем профилактики пьянства и алкоголизма, организованный в 1985 г. в связи с постановлением Правительства СССР о мерах по преодолению пьянства и алкоголизма. В последующем он был переименован в НИИ наркологии, ставший клинической базой кафедры. Сейчас то же самое учреждение называется ФГУ Национальный научный центр наркологии Минздравсоцразвития России. Его возглавляет доктор медицинских наук, профессор Евгения Анатольевна Кошкина. Заведующим кафедрой с 2005 г. является профессор Владимир Васильевич Чирко, крупный учёный, автор и соавтор нескольких монографий, учебника по психиатрии и наркологии, многочисленных учебных пособий и статей, высококвалифицированный клиницист, врач-психиатр-нарколог высшей категории.